Cilleruelo de Arriba está situado en la cuenca del rio Esgueva, en su orilla derecha. Su término, de 18.490 km², cuenta a su vez con una población de 81 habitantes, se tiende al sol del mediodía, y la Villa se eleva 967 metros sobre el nivel del mar. Hasta él llega desde el Mediterráneo, el enebro que aquí se hace compañero de la encina. El suelo es propicio al cereal y así lo entendieron sus fundadores, que a la vista de la primera cosecha de trigo no dudaron de la propiedad del nombre elegido.

Cilleruelo es un nombre varias veces repetido por la provincia de Burgos y deriva de la palabra latina Cella, que posee distintos significados: Celda de monje o de cautivo; celda o despensa de vino; celda o despensa de grano; almacén general; depósito de diezmos, aunque en este caso en nuestra tierra se dice Cilla. Cilleruelo es un derivado que generaliza la palabra, refiriéndola a Cella importante, en sentido agroalimentario.

Cilleruelo de Arriba es atravesada por varias vías pecuarias: Cañada de las Viñas, Cordel del Charcón, Colada de Llano Herrera, Colada de los Navazos, Colada de la Tejera, Colada de Valdembruño, Colada del Molinillo, Cañada de Nebreda, Descansadero Valdegodón, Pastizal del Charcón, Dencansadero de los Herradores, Descansadero de la Tejera y Descansadero de Marmala.

Asi mismo también posee varios libros de Catastro escritos en Castellano antiguo, datados en torno a 1700-1800.